Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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Chmp3Q9CQ10 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Chmp3Q9CQ10 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Chmp3Q9CQ10 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Chmp3Q9CQ10 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Chmp3Q9CQ10 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Chmp3Q9CQ10 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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