Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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