Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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