Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ms4a4dQ99N05 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ms4a4dQ99N05 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ms4a4dQ99N05 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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