Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tm2d1Q99MB3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tm2d1Q99MB3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms