Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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