Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nmd3Q99L48 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nmd3Q99L48 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nmd3Q99L48 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nmd3Q99L48 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nmd3Q99L48 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nmd3Q99L48 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nmd3Q99L48 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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