Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TriobpQ99KW3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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