Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmp1Q99KU0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmp1Q99KU0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmp1Q99KU0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmp1Q99KU0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmp1Q99KU0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vmp1Q99KU0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vmp1Q99KU0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vmp1Q99KU0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vmp1Q99KU0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vmp1Q99KU0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Vmp1Q99KU0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmp1Q99KU0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmp1Q99KU0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmp1Q99KU0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmp1Q99KU0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Vmp1Q99KU0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmp1Q99KU0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Vmp1Q99KU0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmp1Q99KU0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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