Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms