Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd6Q99JI4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms