Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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