Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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