Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ctu1Q99J10 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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