Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn16Q925N4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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