Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms