Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms