Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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