Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk8Q8R3L8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk8Q8R3L8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms