Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc12Q8R344 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms