Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcsapQ8QZT2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms