Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms