Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Depp1Q8K2F3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Depp1Q8K2F3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms