Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms