Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l2Q8JZQ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms