Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rasgef1bQ8JZL7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rasgef1bQ8JZL7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rasgef1bQ8JZL7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rasgef1bQ8JZL7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rasgef1bQ8JZL7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rasgef1bQ8JZL7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms