Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SbsnQ8CIT9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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