Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam228aQ8CDW1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam228aQ8CDW1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms