Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc87Q8CDL9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms