Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms