Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacnb2Q8CC27 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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