Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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