Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms