Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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