Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms