Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco3Q8BH01 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms