Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms