Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms