Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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