Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Clec4b1Q7TS58 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Clec4b1Q7TS58 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Clec4b1Q7TS58 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Clec4b1Q7TS58 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Clec4b1Q7TS58 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Clec4b1Q7TS58 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Clec4b1Q7TS58 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Clec4b1Q7TS58 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec4b1Q7TS58 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms