Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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