Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms