Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms