Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih3Q6ZWS4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms