Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Atp8b3Q6UQ17 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Atp8b3Q6UQ17 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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