Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SvoplQ6PDF3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms