Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rrp12Q6P5B0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms