Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms