Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rcbtb1Q6NXM2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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