Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms